日治初期，鼠疫與瘧疾為臺灣二大傳染病，有鑑於此，日本政府將公共衛生觀念大力引進臺灣，以國家力量與西方醫學觀念執行防疫工作，1920年代後，臺灣主要傳染病大致獲得有效控制。1901年，為有效掌控衛生行政工作，決定增設強勢單位，於是衛生事務單位轉由警察單位負責，並且也透過保甲組織一同執行。1919年，日本政府期望有更高執行成效，開始設置瘧疾防治事務所，對住民每月進行檢診。