二二八事件當時，蔣中正以中國國民黨總裁兼國民政府主席，以黨領政，集中華民國之大權。事件爆發後，蔣不但接獲行政長官陳儀、情治首長葉秀峰與張鎮、省黨部主委李翼中等的報告，也接獲臺灣省民眾代表大會、政治建設協會、台灣旅滬同鄉會等團體，請求勿貿然動武、和平解決的上書。 3月5日蔣中正便派兵支援陳儀，部隊前往臺灣同時確認由國防部長白崇禧代表宣慰，然白部長17日始抵達臺北。而各地羅織罪名肆意逮捕、以軍令肆行殺戮的情況，則持續進行至4月初。事件後，蔣中正在日記中分析情勢，認為事件的暴發是「臺民初附，久受日寇奴化，遺忘祖國」所致，對黨政要員並未咎責。在政府的對外說法中則將複雜的群眾行動渲染為共產黨的組織陰謀，將事件中的殺戮與處份合理化。